Quelques années après le premier épisode, Samus Aran et ses métroïdes sont portés sur GameBoy pour une toute nouvelle mission. Cette fois il s'agit d'éradiquer le mal à sa source, sur la planète SR388 devenue trop dangereuse pour le bien être de la fédération.
Une réalisation à la hauteur de la petite console portable, un scénario qui tient bien la route, le jeu a cependant souffert d'une durée de vie trop faible, mais qui n'a pas su dégoûter les fans du premier pour autant. La preuve : ce jeu est aujourd'hui presque introuvable sur le marché de l'occasion.
Une fois de plus, c'est à Gunpei Yokoi et son équipe de Intelligent Systems (anciennement R&D1) qu'on doit le développement de ce soft, qui a, succès obligé, d'abord été distribué sur le territoire américain.
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